Una vez identificado el posible o posibles socios y, teniendo claro cuál es el objetivo común a alcanzar mediante la cooperación, se inicia el proceso de negociación en el que se deben aproximar posturas en los diferentes aspectos que favorezcan al acuerdo de cooperación y a las partes participantes

Es muy importante tener en mente algunas pautas previas al proceso de negociación. Recuerde que durante la negociación, puede establecer si la elección del socio ha sido correcta o no. En caso de no ser un socio idóneo, este es un buen momento para detener el proceso y comenzar de nuevo.

Durante el proceso de negociación de la cooperación se han de discutir varios aspectos:

¿Cuáles serán las aportaciones de los cooperantes? ¿Cuál es la estructura organizativa del acuerdo de cooperación? ¿Cómo será el sistema de comunicación? ¿Cómo será el sistema de toma de decisiones? ¿Cuáles serán los mecanismos de control? ¿Qué hacer si se presentan conflictos? ¿Cuáles son las reglas de propiedad sobre los resultados? ¿Cómo se regirán la rescisión y el fin de la cooperación?